ただし完全に手動になるので非常に手間がかかります。手順としては動画をフレーム毎に画像へ分割して、画像と画像の間のシーンをモーフィングソフトで作ります。これをスローにしたいシーンの画像に全てに対して行います。最後に全てのシーンを結合して動画を生成すれば完成です。

この非常に手間のかかるモーフィングを利用したスローモーション変換の作業を全自動で行ってくれるソフトとプラグインがあります。しかし、かなりお高く合わせて購入すると20万円ぐらいです。ソフト本体はAdobe After Effects CS5.5。プラグインはTwixtorです。ただし、どんな動画も上手くスローにできるわけではありません。複数の動きがある動画や、速すぎる動画は上手く変換できません。

実際にTwixtorを使っている動画をYouTubeで探して見ました。
この様な仕上がりになります。

モーフィングソフトはSmartMorphやSqirlzMorphなどのフリーソフトがあり、無料で入手できます。どちらも２枚の画像があれば変身動画を作る事ができます。

使用方法は変身前後で移動するポイントを指定し、出力形式(画像または動画)を指定するだけで変身させる事ができます。

この動画は犬を別の犬にモーフィングさせています。ポーズが違うので若干足の変身が上手くいっていませんが。人間に同じポーズをさせて同じ背景で撮影すれば、違和感のない変身動画を作る事ができます。
また画像が２枚あれば何でも変身させる事ができるので、猫から人間、ぬいぐるみから猫、猫から犬など、なんでも変身させる事ができます。

そしてモーフィングソフトで変身シーンをQuickTimeに読み込める形式で出力すれば、QuickTimeで編集する動画の一部として使用できます。